Bioinformatico

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Laboratorio di biologia molecolare con sede a Roma ricerca un/una bioinformatico/a, anche freelance e da remoto, per una collaborazione nell’elaborazione di dati di sequenziamento NGS relativi all’analisi del microbiota.

L’attività richiesta consiste nell’elaborazione di file FASTQ paired-end ottenuti mediante sequenziamento Illumina di ampliconi 16S, principalmente della regione V3–V4, fino alla produzione di tabelle tassonomiche in formato CSV compatibili con il nostro software di refertazione.

Le matrici analizzate comprendono principalmente campioni fecali, vaginali e orali. Il volume previsto è indicativamente di circa 400 campioni al mese.

Costituiscono requisiti preferenziali

- esperienza documentata nell’analisi del microbiota mediante sequenziamento 16S;
- conoscenza di pipeline come QIIME 2, DADA2 o equivalenti;
- esperienza con database tassonomici;
- capacità di sviluppare un workflow riproducibile e automatizzato;
- disponibilità a effettuare inizialmente un test su un piccolo gruppo di campioni già caratterizzati.

Si richiede l’invio di:
- CV e una breve presentazione delle esperienze maturate all’indirizzo , con CC a .

Sede di lavoro: Da remoto

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